软件名称:[B]针叶树0.2.2 Beta版_CoNIFER 0.2.2 Beta[/B]
软件类型:国产软件
运行环境:Win9X/Win2000/WinXP/Win2003/
软件语言:简体中文
授权方式:共享版
软件大小:23.0 KB
官方主页:Home Page
更新时间:2013-02-25 18:16:00
软件简介:

很容易计算出的测序结果

针叶树,也知道作为外显子组阅读拷贝数的推论是一个基于Python的工具,使用外显子组测序数据中找到拷贝数变异(CNVs中)和基因型的重复基因的拷贝数。

外显子组捕获反应强和一批样品的神器出山:www.shenqi73.com系统采集的偏见之间,我们实现了奇异值分解(SVD),以消除这些偏见外显子组数据。

针叶树提供混合外显子组序列消除一批偏见,从多个实验运行的能力。一起读一会儿对准,如mrsFAST可以使读取多个位置,针叶树强劲发现罕见的拷贝数变异和估计的重复基因的拷贝数?8份,目前的外显子捕获试剂盒。

要求:

·的Python
· numpy的
·pysam(可选)
· matplotlib的(可选)


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