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软件名称:[B]磨床0.4.8_Grinder 0.4.8[/B]
软件类型:国产软件
运行环境:Win9X/Win2000/WinXP/Win2003/
软件语言:简体中文
授权方式:共享版
软件大小:196 KB
官方主页:Home Page
更新时间:2013-02-25 18:16:00
软件简介:

工具为产生随机扩增子和猎枪库的

Grinder是一个程序,它允许你创建的人工随机猎枪和扩增子序列库。

一个FASTA文件中的参考序列的基础上生成的库。磨床能产生宏基因组,pyrotag数据集或鸟枪法测序项目,可以用来测试的神器出山:www.shenqi73.com准确性,生物信息学工具之间的替代测序方法,在实验中,帮助决定。

这里是“研磨机”的一些主要特点:

·任意数量的读取和读长度分布
·模拟各种PCR和测序错误:嵌合体,点突变,均聚物
·随机猎枪图书馆或扩增子库(例如16S)
·支持创建配对末端猎枪数据集
具体的排名丰度或手动指定每个基因的丰度
·创建的独立数据集,不共享任何基因组
·创建由不同基因组的长度的偏置建模
·禁止字符
·α和β多样性的要求

要求:

·Perl的

此版本中的新功能:

·修正错误时,扩增产物读取使用指定多个扩增子的基因组的基础上的相对丰度。
·使用消息的改善。
·委托一些操作,以专用模块。


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