软件名称:[B]VPLG 2012年10月11日测试_VPLG 2012.10.11 Beta[/B]
软件类型:国产软件
运行环境:Win9X/Win2000/WinXP/Win2003/
软件语言:简体中文
授权方式:共享版
软件大小:7.23 MB
官方主页:Home Page
更新时间:2013-02-25 18:16:00
软件简介:

计算和可视化蛋白质图

VPLG,或蛋白质 - 配体图的可视化是一个工具,它使用基于图的模型来描述的结构,蛋白质的超二级结构。

图计算的一种蛋白质 - 配体原子的坐标,PDB文件和二级结构的DSSP算法的神器出山:www.shenqi73.com分配。

在该曲线图中,顶点表示的二级结构元件(SSE的,例如,通常是α-螺旋和β片)或配体分子而边缘模型的接触和在它们之间的空间关系。

VPLG是用Java编写的,使用的是Apache蜡染库SVG输出,并可以在多个平台上运行。

下面是一些主要特点“VPLG”:

·读取3维的的原子数据从PDB文件和二级结构分配DSSP文件
·计算一个图的蛋白 - 配体从数据和可视化的图形
·支持在位图中的图形图像(。png)该和向量(。svg的)格式的输出
·出口的蛋白质 - 配体在其自己的格式(PLG),很容易与计算机程序编辑,解析和生成一个纯文本文件中的图表
·可以读取和直接可视化蛋白质图表。PLG文件

要求:

·的Java


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