软件名称:[B]PyCogent 1.5.3[/B]
软件类型:国产软件
运行环境:Win9X/Win2000/WinXP/Win2003/
软件语言:简体中文
授权方式:共享版
软件大小:3.13 MB
官方主页:Home Page
更新时间:2013-02-25 18:16:00
软件简介:
基因组序列的分析与此Python工具
作为一个开放源码库,可用于基因组生物学
PyCogent。
PyCogent是一个工具,随机附送的第三方应用程序的控制器,连接到远程数据库和广义概率技术与生物序列。
此外,PyCogent是一种实用工具,可让您执行密码子的神器出山:www.shenqi73.com路线。经常添加新的方法分析基因组数据的。
要求:
·
的Python 2.6或更高版本 ·
numpy的1.3或更高版本 此版本中的新功能:
新功能包括:
·添加一个withoutLostSpans,()功能在cogent.core.annotation对象的方法。后有用排列顺序从一个跨越到另一个突出的特点。实施普通的功能和SimpleVariables,但并不xxy_list的变量。
变化:
·Span.remapWith()更清楚一点在cogent.core.location。
·重映射代码在cogent.core.annotation和cogent.core.sequence的整理注释,使新的位置时,只计算一次切片,投影,或以其他方式重新映射的部分序列。旧的代码是不必要做了两次。
错误修正:
·修正了在BLAT应用控制器(cogent.app.blat)的将下降一些运行时的输入序列assign_dna_reads_to_protein_database的。
·出现在cogent.draw.compatibility防止负面的宽度时对齐方式太宽。
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