SNAP（可扩展的核苷酸比对程序）是一个命令行工具，可让您快速，准确地对齐序列。它是10至100倍的速度比其他工具，并支持丰富的误差模型，它允许调整读取与多重分歧。 这个工具可以用来在命令提示符窗口中输入命令建立一个基因组指数或对准读取。