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软件名称:[B]mMass 5.4.1[/B]
软件类型:国产软件
运行环境:Win9X/Win2000/WinXP/Win2003/
软件语言:简体中文
授权方式:共享版
软件大小:16.9 MB
官方主页:Home Page
更新时间:2013-02-25 18:16:00
软件简介:

几个模块和工具的蛋白质序列处理和质谱解释

计划mMass提出一个开源多平台的简单的工具包,质谱数据分析。

mMass应用程序由蛋白质序列处理和质谱解释常见的蛋白质组的任务重点在几个模块和工具。

下面是一些主要特点“mMass”:

多格式支持:
·mMass支持多种质谱格式,,,如mzData和mzXML。大量的神器出山:www.shenqi73.com光谱或peaklist的数据,也可以很容易地导入,从简单的ASCII文件,包括制表符,空格,逗号或分号分隔的两列(m / z值和亮度值)。此外,还有一个支持本地数据从布鲁克Daltonic的FLEX系列仪器。

·其中一个的流行特征mMass是能够打开一个空白文档,并手动创建peaklist。光谱图像或印刷的标记峰值列表仅适用于在这种情况下,此功能特别有用。

数据处理:
·最后,有处理功能,如自动峰值的采摘,deisotoping,基线校正和平滑。

校准:
·有两种方法可以进行数据的重新校准。内部校准是经典的标定方法,使用内部参考值。广泛的内部参考值是可以轻松地添加新的值。统计校准,自校准,有时也被称为是一种特殊的方法,可用于肽质谱。对于这两种方法,无论是直链或二次拟合可以使用。

序列工具:
·mMass提供一个内部的序列编辑器,它可以用来使任何蛋白质或肽的序列可用于其他模块。无论是作为固定的或可变的,可以应用于任何修改。蛋白质月刊工具可以被用来在硅片指定的蛋白质序列的酶促或化学消化产生的肽生成的列表。同样,肽裂解工具生成一个列表,常见的肽片段。在这两种情况下,变量的修改的所有可能的组合的计算结果可以很容易地与测量数据相比。此外,序列可以按顺序搜索工具搜索一个特定的肽质量识别非特异性切割等

大众计算器:
·质量计算器工具可以用来模拟同位素模式给出的公式,和生成的配置文件的频谱,可以很容易地与真正的数据比较。

复合搜索:
·复合搜索工具可用于搜索用户指定的任何化合物的光谱。被指定为每一个化合物的分子式,因此,这两个的单一同位素或平均质量可以搜索任何费用。此外,一些加合物可以被搜索。

山顶的区别:
·质谱的解释通常涉及到的光谱中所有峰之间的差异无休止的检查。然而,在山顶的差异比较工具是能够简单地生成一个表之间的所有差异峰在peaklist。然后,此表可以被用来自动比较,指定公差内与各自的所有氨基酸的群众,计算二肽或指定的质量值,每个差。

吉祥物搜索:
·虽然蛋白质鉴定质谱是一种非常流行的工具,它不会有可能没有公开可用的工具的上线。 mMass提供了一个接口,使数据直接发送到吉祥物网站上提供的三个主要工具,肽质量指纹图谱,序列查询和MS / MS离子搜索。

此版本中的新功能:

修正:
·内部服务器已被禁用OS X.
情节帆布崩溃的一个问题。
·信封适合的工具崩溃的问题。


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