软件名称:[B]SnpSift 1.8[/B]
软件类型:国产软件
运行环境:Win9X/Win2000/WinXP/Win2003/
软件语言:简体中文
授权方式:共享版
软件大小:6.15 MB
官方主页:Home Page
更新时间:2013-02-25 18:16:00
软件简介:
轻松操作VCF文件从CLI
SnpSift是一个简单的和可访问的工具,可以帮助您处理变量调用格式文件(VCF)的集合。
SnpSift的目的是使用Java编程语言,并可以运行在所有主要的操作系统。
下面是一些主要特点“SnpSift”:
·过滤器:您可以使用任意表达式来过滤,例如“(QUAL> 30)|(存在INDEL)|(countHet 2)”。实际的
神器出山:www.shenqi73.com表现形式可以是相当复杂的,所以它允许了很大的灵活性。
注解:您可以添加从另一个数据库中的'ID'(例如,从dbSNP数据库的变种)
·病例对照:许多变体是如何在“案例”和“控制”组中,您可以比较。此外,还计算p值(Fisher精确检验)。
·TSTV:颠换比计算跃迁。
·时间:过滤器变种相交的时间间隔。
·RmRefGen:删除参考基因型(即替换“0/0”型的'。')
要求:
·
的Java
[url=http://www.sot9.com/soft/70277.html][B]SnpSift 1.8[/B][/url]
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