软件名称:[B]snpEff3.1米生成2013年2月7日/ 3.2_snpEff 3.1m Build 2013.02.07 / 3.2 Development[/B]
软件类型:国产软件
运行环境:Win9X/Win2000/WinXP/Win2003/
软件语言:简体中文
授权方式:共享版
软件大小:75.0 MB
官方主页:Home Page
更新时间:2013-02-25 18:16:00
软件简介:

影响预测的实用工具,你可以使用

snpEff被设计成一个变种效果的预测程序,可以运行命令行。它始建于以预测的遗传变异(单核苷酸多态性,插入,删除和MNPS)的影响。

snpEff使用Java编程语言开发的,可以运行在所有主要的操作系统。

要求:

·神器出山:www.shenqi73.comJava

此版本中的新功能:

·所有的NCBI细菌的基因组超过2,500基因组添加!
·功能的影响和损失标签(实验上的命令行选项“-LOF)
·无义介导的衰减效应和标签(实验上的命令行选项“-LOF)
·ENSEMBL版本增加68基因组
·SnpEff“countReads数数的读取和基地形成一个BAM文件上的每一个基因,转录,外显子,内含子,等
·SnpEff内含子和基因间的注解提高。


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