BioImageXD 1.0 RC 3

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BioImageXD 1.0 RC 3

软件进行分析和可视化的的多维生物医学图像

BioImageXD是一个软件包，多维图像数据进行处理，分析和可视化。正如其名称所暗示的，该软件主要是用于与生物数据，例如活细胞的共聚焦显微镜图像，但它是完全适用于使用多层面的神器出山:www.shenqi73.com图象数据的任何种。

BioImageXD有一个简单的，直观的用户界面，基于一个单一的大窗口，其业务已设计是一致的，功能。

BioImageXD将提供先进的文件输入/输出功能和多种可视化模式（范围从简单的二维切片视图，以先进的3D渲染），这些都可以自由组合的众多任务模式（包括信道合并，共定位分析，强度校正和各种过滤器，用于去除噪声，分割，跟踪，测量等）。

建于animater允许您创建令人惊叹的movues，因为它有完整的控制的相机pathsm时间点的变化和视角。

下面是一些主要特点“BioImageXD”：

图片查看：
·开放的数据在普通显微镜格式（或图像或堆叠的图像，时间序列），和图像查看数据图像。

图像处理：
·调整颜色/亮度/对比度/伽玛，改变颜色或调色板的一个数据集/信道，滤除噪声，正确的时间序列数据中的荧光漂白。

三维体积渲染：
·3D数据集可以交互量呈现

电影制作：
·使用动画模块设置相机路径周围的三维数据，它旋转和缩放任何你喜欢的方式飞行，但拍电影。时间序列数据支持“4D的数据”。

Colocalisation分析：
我们知道所有的细胞生物学家，利用共聚焦显微镜一直在寻找colocalisation！我们的colocalisation工具使您能够分析信号强度的colocalisation在一个多通道三维数据集，避免假colocalisation问题出现在Z-Stack的投影图像，并进行统计分析，给你确切的数字的数量和质量中的数据colocalisation。使用类似的算法，以那些在ImageJ的，例如“WCIF插件自动Colocalisation阈值，使用的方法科斯特等。

AFM图像浏览：
·原子力显微镜和成像技术使图像可以呈现为3D曲面。我们还可以添加一些有用的图像过滤器之类的。也许有某种原子力显微镜形状 - PDB还是冰冻蚀刻电镜结构/模型拟合工具。 Comaprison细胞表面的高度图像聚焦3D数据集。

多处理器，并行计算，集群和超级计算机：
·作为的FinHPC项目的一部分，我们计划使BioImageXD平行和CPU特定的向量化代码（速度/ Altivec的引擎G4和G5，和MMX SSE SSE2 SSE3在ix86），在台式机上运行图像处理等功能，大型共享内存的集群，工作站，服务器和超级计算机

此版本中的新功能：

·64位Windows版本，64位Linux和64位Mac OSX 10.6。
·入门指南包含在软件中。
·增强的GUI功能，包括所有的过滤器的描述和输入/输出图像类型。
·支持8/12/16/32灰度图像，RGB图像和32位和64位标签的图像。
·MRC文件格式的阅读器。
·支持多页TIFF文件。
·改进的内存处理。
许多修复的错误。
·库：VTK 5.6.1，ITK 3.20。
·三维可视化的多渠道没有分组。
·过滤器反褶积和数学代PSF。
·FRAP分析的可能性。
许多新注册的过滤器。
·傅立叶和傅立叶逆变换。低通和高通滤波器。
·过滤器来去除背景图像梯度。
·高斯滤波器，以提高现场检测的差异。
·可能性大小，边界连接和圆的对象进行过滤。

新的过滤器程序列表中的任务（21）：
·平均数（平滑）
·PSF代（反褶积）
·迭代反褶积（...