OPSM矿工2.0_OPSM Miner 2.0

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OPSM矿工2.0_OPSM Miner 2.0

制表符分隔的ASCII文件

此包提供了的OPSM矿工和信息化项目。

输入
- 制表符分隔的ASCII文件。行是组织，列基因的表达。一行可能包含一个标题列，他们可能是一个标题行。在任何情况下，所有行的神器出山:www.shenqi73.com列数应等于。
- 标题行和列可能包含的任何字符串，所有其他值都必须包含数字。
- 矩阵大小为T（组织）×G（基因表达）。

算法和标志
该算法执行DFS纵向比较，这意味着这两个基因的表达进行了比较。

- “核双比较” - 预构建的表达载体对，这将采取GxGxT的大小在内存中，所以一定要确保它可以容纳的内存。
- “支持” - 许多组织，其中包含一个模式。设置应用程序的支持，这个数量最少的组织要包含你正在寻找的模式。设定一个非常高的数字，会产生很少的模式，非常低的数字 - 和采矿可能无法完成（指数模式）。
- “最小长度”，“最大长度” - 你正在寻找的图案大小。设置“最小长度”，因此应用程序不会返回很短，而且有趣的图案。 “最大长度”设置，以减少运行时间。
- “最大的错误” - 仅适用于OPSM与错误。的OPSM搜索为精确的模式。 OPSM算一个组织与错误，即使它包含一个X数量的基因，不适合的模式。
- “麦斯集团长度” - OPSM的团体，模式，而不是单个基因的基因组之间的比较。例如，模式将是：（0.4 0.6 0.4）（0.7?0.8）（0.9 0.95）
- “最大层变化” - 不记得了...

如何使用OPSM层算法
当设置为层应该有一个层为数据集文件具有相同名称的，所附的“层”的定义文件。

例如：
SaltDat.txt
SaltDat.txt.layers

文件格式 - 每一行代表一个层。每个层是一个范围的列：
0-5
6-10
...
...

要求：

·<框架2.0

此版本中的新功能：

·更新版本，超过1.0 300aster。
·需要。NET Framework 2.0版