Useq 8.5.8

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Useq 8.5.8

测序数据的分析变得容易

使用q下一代超高通量的签名测序数据的分析水平低和高的设计是一个软件工具的集合。

现在，您可以使用这个基于Java的工具，能够快速分析Illumina的，坚实的，以及其他多个平台的新一代测序数据。

要求：

·相关 Java 1.6 +
·R层的神器出山:www.shenqi73.comQ值和Anders的DESeq库
·熟悉命令行编程

此版本中的新功能：

·SamTranscriptomeParser
·修改应用程序，以gzip压缩临时文件，当一个头直接写出来的结果没有中间文件。应该减少磁盘使用情况。
·NovoalignBisulfiteParser
·默认的阈值最低基数质量降低到13。新的双起的数据显示降低品质造成某些数据集（可能是由于不同的校准）显示出显着减少数据。
·新增的一小部分基地，通过基地的质量报告这种情况下，统计和标志。
·VCFComparator
·增加了一个新的电子表格只是DFDR每个样品的TPR当不止一个，使图形更容易。