SimGlycan 2.75体形264005可_SimGlycan 2.75 Build 264005

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SimGlycan 2.75体形264005可_SimGlycan 2.75 Build 264005

inovative MS / MS数据分析工具。

SimGlycan预测的糖链的结构通过质谱法获取从MS / MS数据，促进糖基化的研究，并翻译后修饰的研究。

SimGlycan接受实验的MS产生的质谱仪公司，它们用其自己的数据库超过8,000聚糖的神器出山:www.shenqi73.com理论碎片相匹配，并生成可能的聚糖结构的列表。

每个结构都拿下来反映如何密切与实验数据相匹配。其他可能聚糖聚糖类，反应，途径和酶的结构，如生物信息，以供参考。 SimGlycan预测的糖链结构，分数它，并生成一个列表，可能聚糖的实验MS配置文件，节省您的时间和挫折费力的工作，密切配合的。

blue">一些关键功能“SimGlycan”的：

强大的糖基数据库
·SimGlycan数据库是一种大型关系数据库，人口与已知的由62个不同的单糖的糖链结构的理论碎片。在数据库中的每一个的糖链被分段为每个可能的51的反应条件下，使用一个密集的碎片算法。这将确保可能聚糖片段的报道是全面的，准确的。
·我们已经尽全力在填充数据库，使其非常高的质量，从而实现可靠的数据挖掘，为未来的应用糖生物学。 SimGlycan数据库支持8184聚糖，5296生物学源，3774聚糖组成，5620类，204的生化反应，生化途径150，184酶和8143的数据库链接。

综合作用的结果分析
·对于每一个可能的聚糖结构，SimGlycan聚糖片段，序列，结构，组成，聚糖质量，等级，反应途径，酶和其他的数据库的链接（CarbBank）。
·SimGlycan接受实验m / z和强度值从质谱仪产生两者都被释放的糖链和糖肽。它可以让你指定的数量的天线，减少的终端单糖和预期的非还原性末端的单糖的结构，从而提高最终搜索结果的准确性。可接受的文件格式，包括简单的文本文件，。xls文件或标准输出文件格式，如mzData和mzXML。不管是什么使您的仪器，输出可以使用第三方工具转换成这些格式。其他原始文件格式，如wiff，T2D质谱仪从美国应用生物系统公司，4800加MALDI TOF / TOF分析仪，4000 QTRAP系统和QSTAR Elite系统，所产生的直接支持的程序。

准确的糖基排名
·所有可能的聚糖结构进行排名，并取得了我们专有的搜索和评分算法的基础上。排名算法是基于计算聚糖得分，这是如何接近的聚糖实验质量是我们的数据库中包含的糖链的质量的数值表示。聚糖具有相同质量的排名在降低其强度的顺序。
·A聚糖随着他们的成绩列表会显示在“搜索结果”窗格中。收视率最高的糖链序列显示在列表顶部。这聚糖聚糖结构最有可能的，其余的发生概率。片段的命名法是基于标准的土门科斯特洛规则（1988）的分散在Cooper等人描述的规则。 （1999）

项目管理
·SimGlycan提供了一个全面的项目管理，结果与输入的个人资料和搜索参数相关联。你可以打开任意数量的项目。每个项目最多可以包含到10 MS配置文件。可分为源的基础上，在实验室或研究目的的项目。这是很重要的，尤其是当进行大型项目。
·您在点击一个按钮，可以访问聚糖相关信息。与基于Web的应用程序，SimGlycan将其保存在自己的电脑上。

糖链结构：
·显示的聚糖的分子结构（碳水化合物序列）。

糖基片段：
·显示的命名，结构，m / z值和大规模使用土门科斯特洛规则的碎片。一个序列号分配给每个片段。

生成报告：
·您可以创建一个全面聚糖为您的实验室笔记本，出版，或与您的同事共享信息的检索报告。该报告包括糖等特点的ID，序列，名称，成分，质量，前体离子m / z类，反应，随着聚糖及其可能的理论片段的图形视图的途径。
·SimGlycan突出的m / z值相匹配理论的片段。在他们的选择中，它的故事情节，诠释，和出口的MS。png格式的档案为您的实验室笔记本。使用一个简单的界面，你可以切换栏和散点图之间，放大成具体的情节区域，指定m / z范围来显示特定的情节部分。
·SimGlycan使您能够指定自己的排名预测结构，添加注释和搜索片段的质量，名称和m / z值。

要求：

·CPU：奔腾III
·RAM：256 MB
·硬盘空间：500 MB
·屏幕分辨率：800×600

限制：

·充分体现了每一个功能和功能的产品，但仅限于提供的样本数据。

此版本中的新功能：

·SimGlycan现在包括解决糖肽的全面支持。您现在可以分析一个完全未知的糖肽的结构完整的。 SimGlycan搜索所有可能的聚糖肽组合和之间的理论和实验数据的显示比例匹配。这有助于理解可能的糖肽的结构和实验的MS更新之间的接近程度。

·除了肽聚糖/肽片段的显示比例匹配，SimGlycan还强调了所有的匹配和不匹配的片段，使其更容易地确定可能的结构。