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更新时间:2013-02-25 18:16:00
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DNAdistree推断基于距离的系统发育树显示在物种间的准确的拓扑关系。更确切地说,DNAdistree执行几个连续的步骤:
1。它读取DNA序列比对(核苷酸或密码子);
2。它估计的神器出山:www.shenqi73.com中立成对的序列的每个对之间的距离。对于这一目标,DNAdistree使用了大量的公式,往往是基于DNA或密码子模式(在这里看到的更多的细节)的演化模型;
3。构建系统发育树感谢四个凝聚算法;
4。计算统计的相关措施,以距离矩阵和/或基于距离的树木。
然而,DNAdistree没有强大的分支长度估计,它是推荐使用惠誉(在的PHYLIP包),FastME,PHYML或PAML的树木用户树为更精确的距离或基于ML-分支长度推断DNAdistree估计。DNAdistree一个尝试,看看它的真正能力!
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