斯特普:SVM技术评估肽段1.3_STEPP: SVM Technique for Evaluating Proteotypic Peptides 1.3

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运行环境:WinXP/Win7/Win8/Win10/Win All
软件语言:简体中文
软件类型:国产软件 - 科技软件
授权方式:共享版
软件大小:711 KB
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更新时间:2013-02-25 18:16:00
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  • 应用用于评估肽段

    STEPP是一个先进的工具,设计计算的得分“的蛋白肽是由LC-MS。该程序可以读取一个蛋白质的文件,执行,硅片消化,并计算每个胰蛋白酶或的部分胰蛋白酶肽的可观成绩。需要注意的是较大的神器出山:www.shenqi73.com(正)分数的意思是被预测为更多的蛋白,而较低的(负)的分数的意思是还没有预测的肽是蛋白典型的肽。

    由斯特普的SVM模型是一个简单的描述符空间的基础上氨基酸含量的35项物业,负责,亲水性和极性肽段的定量预测。该模型进行了训练和验证,有三个独立计算得出的AMT数据库(希瓦氏菌oneidensis,鼠伤寒沙门氏菌,耶尔森氏鼠疫杆菌)。的SVM导致的平均精确度?0.8

    的要求:小于0.025,标准偏差。

    ·的Java

    此版本中的新功能:

    ·固定的培训支持向量方法和规范。原训练集是不正确的。
    ·固定式多线程的问题,单一的肽/蛋白质输入文件显示进度条。


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