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更新时间:2013-02-25 18:16:00
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STEPP是一个先进的工具,设计计算的得分“的蛋白肽是由LC-MS。该程序可以读取一个蛋白质的文件,执行,硅片消化,并计算每个胰蛋白酶或的部分胰蛋白酶肽的可观成绩。需要注意的是较大的神器出山:www.shenqi73.com(正)分数的意思是被预测为更多的蛋白,而较低的(负)的分数的意思是还没有预测的肽是蛋白典型的肽。
由斯特普的SVM模型是一个简单的描述符空间的基础上氨基酸含量的35项物业,负责,亲水性和极性肽段的定量预测。该模型进行了训练和验证,有三个独立计算得出的AMT数据库(希瓦氏菌oneidensis,鼠伤寒沙门氏菌,耶尔森氏鼠疫杆菌)。的SVM导致的平均精确度?0.8
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