BAMarray 3.0.0

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BAMarray 3.0.0

贝叶斯方差分析微阵列

BAMarray是一种先进的和专业的应用程序，实现BAM tehcnique的。 BAM是一种新的统计方法，检测差异表达基因的微阵列数据。在心脏的方法，是一种特殊类型的信号检测技术，瓜类虚假信号的同时，仅留下实数信号。

标准的神器出山:www.shenqi73.com方法，寻找基因的依靠初级测试的时间（如t-检验，或从方差分析模型的对比）的统计数据，从一个基因。基因列表过滤的统计资料，试图控制整体的I型错误或虚假的发现率，或通过使用用户指定的临界值过滤。

BAM需要根本不同的方法和重点，而不是估计的差分合成的基因同时在所有基因信息。而不是筛选基因，估计效果图案类型映射到。

BAM的特殊信号检测的机制缩小到零，估计不太可能为基因差异表达，从而模式的兴趣解释使用的图形可视化工具。利益格局可能是“打了就跑”的基因影响的生物系统，只有在一定的时间内，或在整个过程中所涉及的基因。

BAM适用于多组的实验设计，如收集的数据的一种疾病的不同阶段。其他应用包括基因表达的时间过程数据的时间分析，异常检测，不变集正常化，基因图谱转录的映射，以及许多其他的问题。

下面是一些主要特点“BAMarray”：

·BAMarray是一个用户友好的Java应用程序运行在不同的操作系统。
·BAMarray可以在批处理模式下启动一个脚本文件，也可以无人值守运行。批处理模式下可以按顺序处理多个数据文件，并保存到磁盘的分析结果。编写自定义脚本允许用户界面与不同类型的软件，如Bioconductor，R.
·BAMarray有一个节省运行功能，使用户能够运行的结果保存，以备日后检索。可以恢复，可能需要几分钟来执行一个运行在短短几秒钟，恢复运行。节省运行也可以在批处理模式下触发。
·无限组的实验设计与入住。可视情节是可识别特定类型的基因模式。 BAMarray自动将基因导入基因模式。
·BAMarray几乎是自动的，并且复杂的调谐参数。
·大多数统计方法都需要用户指定的过滤值确定显著基因。 BAMarray提供了一个自动化的价值。
·不等基因组和实验组之间的差异的系统处理由一个自动化的前处理步骤，不人为地抑制或放大跨越基因（如看到与其他的变换，如对数）的组间差异。
·图形放大和套索工具允许用户以交互方式产生的基因列表。
·基因标签，可以打开或关闭允许的利益很容易识别的基因。使用下拉列表或填充跟踪列表从现有文件中发现的基因标签，可以突出显示特定的基因。
·基因列表可以导出。使用批处理模式，可以自动导出列表。
·图可以保存为出版高质量的彩色图形。
·的地块用于测试的基本假设的模型中包含的图形套件的一部分。
·支持JRE 6。

要求：

·的Java
·512 MB RAM
·100 MB硬盘驱动器上的可用磁盘空间