ProSAT

蛋白质残基注释工具包

ProSAT工具包的开发是一组程序，允许建立基于支持向量机模型标注氨基酸残基的蛋白质序列使用用户提供的功能（如PSI-BLAST型材，或PSIPred的配置文件）。

特别是，该工具包生成功能，使用一个窗口周围的残余物，并配备有一个专门的核函数（归一化的二阶指数的核函数nsoe）沿与标准的神器出山:www.shenqi73.comsvm核函数。

ProSAT_Learn 是程序学习“N”一对其余分类模型，其中n是可能的一些注解。它也可以学到支持向量回归模型来预测一个浮点值。

用途
ProSAT_Learn [选项]

ProSAT_Predict 是程序从内置机型，各残基，预测的注解和输出一个L XN尺寸配置文件的，输出的得分从每个的n 1抗其余SVM模型为每个氨基酸残基和L是蛋白质序列的长度。在一个回归模型的情况下，N = 1。

用途
ProSAT_Predict

输入
ProSAT_Predict有三个必需的参数：
- 测试文件：测试文件提供的序列特征，我们需要预测的注解的配置文件列表。它是类似于用于在ProSAT_Learn除了它不包含真正的注释文件的名称的输入文件，因为我们预测相同。
- 模型文件：模型文件的模型文件输出ProSAT_Learn
- 的的预测文件：预测文件提供的注释的配置文件的形式输出预测的路径和前缀。

输出
输出由一组预测的注释和配置文件，这是什么，但的SVM预测，从每个“民元素”SVM模型。