精灵3.0_Genie 3.0

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程序的人口历史的推理分子系统学

精灵的名字代表为家谱间隔浏览器。精灵的开发是一个重建的分子系统发育的人口历史的推理程序。

它主要是设计用于重建从高度可变的病毒基因序列的系统发育分析，但可以适用于其他类型的神器出山:www.shenqi73.com序列数据，包含一个显着量的系统发育信息。

GENIE有一个新的命令行的用户界面，类似的PAUP和MrBayes使用的接口。 GENIE命令可以在一个输入的时间，拼凑成一个文件，然后运行脚本。

的每个GENIE命令具有以下结构：的

commandname的commandValue subcommand1 =值subcommand2 =值...

本发行版中的新功能：

路树与非同期的提示（TipDate树木）的阅读和分析。病毒序列数据集，这应该证明是非常有用的。参数的人口模型和经典的天际线图TipDate树木。
路的用户界面已经改变，从一个菜单系统的命令行系统。命令可以输入或从NEXUS格式文件的读取。因此，该接口是类似的命令行版本的PAUP *。
路，GENIE现在读，并写入NEXUS格式的树木。 PHYLIP格式的树木不再受支持。
路优化广义的天际线图的两种新方法已被添加。
路其结果可重新调节到一个真正的使用有关的序列置换率的时间尺度。
路两个新的人口模型已被添加分段的物流增长和分段扩张的增长。
路通时间谱系图现在可以被输出。
路已被删除，因为它是无效的大多数数据集Kolmorgorov-Smirnov检验。