PeakFinder 1.0

定位峰（黏合结合位点），在酵母芯片芯片技术数据

在PeakFinder应用的开发，是一个工具，，位于峰（黏合结合位点），在酵母片（染色质免疫沉淀）芯片技术的数据。

PeakFinder是一个基因组可视化工具，搜索“峰”芯片比数据。峰被发现使用平滑的神器出山:www.shenqi73.com曲线，可以选择交互方式。核苷酸含量可以使用一个指定的移动窗口一起显示的微阵列结果。该计划的任何基因组，几乎是通用的，但仍然有一些酵母唯一的参数。

输入文件：
- GenomeIndex.dat文件：坐标，告诉每个染色体的基因组内的位置。着丝粒的位置也被指定。
- “的要素坐标”Excel工作表：列A，B和C必须是名称，Coord1，Coord2。坐标是每个功能基因组坐标。
- “比率”基因芯片数据的Excel工作表：A栏必须是“INAME”。比率的数据被假定为在最后一列。的的功能“INAME”值必须马赫的要素坐标表所规定。
- 目录的核苷酸序列，每个染色体的一个文件。序列数据可以在FASTA的格式与一个defline，或仅仅是一个ASCII文件。该文件的文件名必须是字符*或chrNN的*。例如，chr05.fsa，或chrviii_562639.ascii的。无论是“老字号”或“新”的文件格式，从酵母基因组数据库是可以接受的。
- PeakFinder.INI是在目录C：\文件和设置\ \本地设置\应用数据\ StowersInstitute \ PeakFinder

输出文件：
- 图表将自动放置在剪贴板上，如果位图或图元文件的选项被选中，并且可以直接粘贴到任何其他应用程序后，显示。 （取消选中“自动保存图表中停止自动放置在剪贴板上的图表）。否则，按“保存”按钮的走势tabsheet上保存图表到指定的GIF文件。
- 保存的峰按钮的峰tabsheet上可以选择，保存Peaks.csv文件，可以在Excel中打开。
- “过程”的按钮在一组正在制作的文件的rawData tabsheet的效果。通常指定一个新的目录时，它会包含这些文件的处理完成RatioFileName.dat，RatioFilename ChromosomeNN.gif（NN = 01?16），和RatioFileName Peaks.csv中，其中RatioFileName是比Excel中的名称文件指定原始数据tabsheet。