3DiCSI 1.9.11

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3DiCSI 1.9.11

，分析CSI数据的快速和容易的。

3DiCSI是一种体积小，操作简单，易于使用的开发的应用程序，以帮助您理解化学位移成像（CSI）数据。

它结合了数据可视化，光谱处理，光谱定位和估计，光谱量化一起多变量分析方法，如主成分分析（PCA）和约束非负矩阵的神器出山:www.shenqi73.com分解（CNMF），。

CNMF特别是，提供了一个有效的方式来恢复物理意义的相关光谱模式。

下面是一些主要特点“3DiCSI”：

数据输入和可视化：
·自动进口1D/2D/3D CSI飞利浦，GE，西门子和布鲁克扫描仪的原始数据。
·进口任何未知的数据类型可以通过手动输入参数。
·任何其他格式的文件，还支持通过第三方插件。
·CSI数据和解剖参考图像进行登记，并显示在同一个窗口。
·每个体素被显示在一个单独的窗口，它的空间位置清楚地显示在三个正交的图像窗口。
·三维图像重建的图像在一个方向。

多维的光谱数据处理：
·恒定的相位和线性相位修正。
·时间滤波（高斯，洛仑兹，或组合）。
·空间平滑（海明，余弦，费米）。
·基线校正。
·水抑制。
·PPM的的原点调整和零填充。
·脂质抑制。
·峰对齐。

批处理：
·序列的处理步骤可被记录在一个宏文件，并应用到CSI数据集。
·相同的宏文件可以应用到在一个批处理模式下的一系列的考试。

光谱本地化：
·实时鼠标促进互动体素在所有3个维度转移。
·选择了多体素的平均。
·用户的谱估计中的绘制的2D/3D的感兴趣的区域。

多变量谱分析：
·主成分分析（PCA）用于用户定义的频谱区域和投资回报率（ROI），以确定主成分（PC）的CSI数据中包含的变异的来源。
·基于PCA-迭代峰值调整程序，以消除频率和相位变化。
·约束的非负矩阵的分解（CNMF）的方法来恢复光谱模式及其空间分布是有物理意义的。

光谱定量：
·的代谢地图生成区域整合和PCA。
·地图生成峰率和用户定义的区域。
·绝对定量的代谢物浓度的参考光谱。
·地图显示比例的调整，以使不同的组之间的比较。
·集成了用户控制的基线校正光谱。

数据输出：
·各种结果的输出选项，如HTML格式的报告，CSI片和图像打印出来，显示复制和粘贴功能，光谱ASCII /二进制出口，代谢图像出口。

程序的可扩展性：
·插件机制，以支持由第三方开发的CSI数据输入模块。