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设计的应用程序特定的捕获探针直接杂交检测。
PrimerPlex设计复用的寡核苷酸进行多重分析平台,如Luminex公司100 200 200,Luminex公司,生物复杂悬浮阵列系统是一种高效,精密的工具。基于Luminex公司的神器出山:www.shenqi73.comxMAP技术,这些系统提供一个通用平台,在96孔板格式的多重核酸检测。
PrimerPlex设计特定的捕获直接杂交检测探针和引物等位基因特异性PCR扩展(ASPE),复用高通量的SNP基因分型应用,如SNP分析,病原体检测,菌株分型和单体型。寡核苷酸设计后确定的BLAST搜索,避免了区域的同源性。
PrimerPlex检查的寡核苷酸交叉的同源性,最大限度地减少的Tm不匹配给你的最好的可能的的多重set.In的过程,分析可能的复用集在一瞬间。
此外,PrimerPlex提出了一个替代为您设置的列表选择,根据您的具体实验需要。
下面是一些主要特点“PrimerPlex”:
综合检测支持:
·使用PrimerPlex,设计寡核苷酸的ASPE及直接杂交检测。这两种检测的多重分析。探针同时检测的交叉同源性筛选,以确保信号强度高。该方案不仅设计用于检测寡核苷酸的序列,但使您能够设计相应的放大,以及对引物。二聚体,运行,并且重复的寡核苷酸筛选。
SNP检测和基因分型:
·与PrimerPlex,您可以设计ASPE引物的3'端的SNP和捕获探针直接杂交检测。
探头特异性:
·搜索多个序列的BLAST程序运行在一个单一的搜索。结果将自动解释和确定的同源性,避免在探头设计,确保设计是非常具体的。
多重PCR引物设计:
·设计复用底漆设置工作是一项具有挑战性的任务。 PrimerPlex使用创新和专有算法,设计出最佳的引物组合,最大限度地减少的Tm不匹配,工作在单管多重检测多达100个目标。所有集进行分析的交叉兼容性和跨到其他目标的同源性,以确保具体和有效的放大。
·你可以选择一套最适合你的实验需要从不同的排序顺序交替的列表。使用PrimerPlex,你有向3'末端设计引物的5'末端,在一个指定的距离或从这些端部的序列内的任何位置的灵活性。
·SNP基因分型分析,方案设计引物,两侧的单核苷酸多态性。包括能够指定绑定的上游或下游的SNP的引物的距离。
数据导出:
·在制表符分隔的格式或数据导出为html页面,方便订购或加载到一个中央数据库。它也导出XML格式的BLAST结果。
项目:
·允许创建多个项目。大量的数据,可以方便地组织和管理,通过创建一个单独的项目,每个实验。
内置数据库:
·维护本地数据库序列信息和搜索结果。
要求:
·CPU奔腾III
·RAM 128 MB的可用内存
·硬盘驱动器的可用硬盘
空间200 MB
·屏幕分辨率为800 X 600
限制:
·充分体现了每一个功能和功能的产品,但仅限于提供的样本数据
·保存功能被禁用
·纳格屏幕