JDotter

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JDotter

基于Java的点阵浏览器

JDotter，也被称为Java点图比对的是一个独立于平台的基于Java的交互式工具Linux版本的红人，是一种广泛使用的程序，以产生大的DNA或蛋白质序列的dotplots。

JDotter运行的客户端 - 服务器应用程序，并可以发送新序列红人程序，对齐方式，以及快速访问的神器出山:www.shenqi73.com预处理dotplots库。

JDotter还可以通过接口与序列数据库或文件系统中，为了显示补充的特征数据。

因此，JDotter大大简化了数据访问dotplot在实验室中处理大量的基因组，并有一个多平台的组织。

下面是一些主要特点“JDotter”：

·创建全基因组，基因组或蛋白质点图，从用户提供的序列;
·快速加载的挥发性有机化合物数据库的完整基因组的预先计算的地块;
·查看和导航的地块，要找准插入/缺失和评估整体基因组的相似性;
·打印/保存点图JDotter或JPEG格式。

要求：

·的Java