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PyDSTool 0.88.110826 Beta版_PyDSTool 0.88.110826 Beta
计算工具,以帮助您与您的开发
PyDSTool是一个基于Python的工具,它的目的是提供了一套强大的动力系统的发展,模拟和分析的计算工具。
此系统的使用在许多科学学科的物理过程的建模。
作为数据驱动的神器出山:www.shenqi73.com建模过程的一部分,该强调的是放置在载体上的数据分析。保持常微分方程(常微分方程),微分代数方程模块(DAE)和离散地图模型上的焦点。
下面是一些主要特点“PyDSTool”:
·高效和国家的最先进的ODE / DAE /离散的的地图模拟工具(使用动态链接和自动生成的C代码,如果外部编译器)(见发电机)
·混合模型和事件驱动的仿真支持(HybridSystems)
·模拟和分析,可以强制“边界
安全”,例如:对于非负保护“(见BoundsSafety)
·分岔分析和延续,通过内置的工具PyCont
·支持数据驱动的建模(见DataDrivenModels)
·交互式命令行/基于脚本的界面
·“索引”和上下文大量的数据结构,包括一个增强版本的数组(见Pointsets)
·符号表达工具(包括评估,替代,衍生工具,一些简化)(见符号)
·轻松建立复杂的模型采用层次化的面向对象的数据结构,其中包含组合的型号规格(见ModelSpec)
·内存管理实用程序,数据导入和导出(包括[WWW] SBML转换和LaTeX的标记通过SloppyCell包的 - 看到该页面的详细信息)
·模块化的代码设计,可方便地扩展以支持其他算法(捐款欢迎)
·数据结构和工具包为参数估计/模型拟合和其他的时间序列和数据驱动的问题(见参数估计)
·无缝使用的工具,在SciPy的,numpy的,通过动态类型
·额外的工具箱的具体应用,包括生物力学模型,计算神经科学,系统生物学(见ToolboxDocumentation)
许多实例教程和文档可在网上这个Wiki
要求:
·
的Python 2.5 ·
SciPy的0.6.0 ·
numpy的1.0.4 ·
matplotlib的0.91.2 ·
PyWin32 2.10 ·
SWIG 1.3.31 ·
的MinGW 此版本中的新功能:
·采用最新的numpy的/ scipy的版本的兼容
·效率PyCont改进
·添加了一些改进,相平面分析工具箱。
·修正了各种错误
·改进的API的各种函数和类
·增加了一些额外的
文件 创建了一个Euler_ODEsystem,用于测试和简单的(例如演示)集成,支持用户定义的调用之前和之后的步骤