pppBenchmark 1.3

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pppBenchmark 1.3

大规模的基准研究的17个国家的最先进的启动子预测程序

建议可以被用来作为启动子预测评价的黄金标准，使启动子预测软件的作者，他们的方法比现有的方法以适当的方式

这是一个多方位的评估策略。

这个评估战略随后被用来比较选择的神器出山:www.shenqi73.com启动子的预测，并进行了深入的分析，预测性能，子类特异性的预测之间的重叠和位置偏差的预测。

当使用这个程序来验证新开发的程序，它是很重要的，你不使用的数据作为训练数据在pppBenchmark验证你的程序中使用。

正确的程序，这里将是分裂的培训和测试中的数据，并且为每个分割运行程序和pppBenchmark，。最好的方式来分割数据是完整的染色体水平上。例如使用23条染色体进行培训和进行验证。这样做对每个染色体离开了。

取得pppBenchmark，并给它一个尝试，看看是多么有用，它实际上是你！

要求：

路的Java

此版本中的新功能：

路根据用户的反馈，我们已经做了一些修改，以pppBenchmark。我们增加了 - prefix选项给所有输出文件的前缀。召回和精密轴翻转，这可以稍微更准确的计算的auPRC的一条光滑的曲线，没有点必须被丢弃。