caTIES 4.2

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解编程编码信息从自由文本的外科病理报告

的

caTIES或癌症的文本信息抽取系统是一个项目集中在两个重要的挑战bioinformatics.The问题，要被克服了从自由文本信息提取和组织的访问。

具体而言，caTIES有三个主要目标：
·解压缩编码信息自由文本外科病理学报告（SPR），使用受控的神器出山:www.shenqi73.com术语来填充的caBIG-兼容的数据结构的。
·为研究人员提供查询，浏览和创建订单注明的组织在网络上联邦数据源的数据和材料物理的能力。在caTIES的SPR作为组织资源的定位器。
·先锋分布范围内的caBIG的文本信息抽取的研究。

下面是一些主要特点“caTIES”：

编码特点：
·从语义编码文字与从NCI Metathesaurus中的概念。
分类编码的概念，诊断，过程或器官类型。
·使用一个内置的否定引擎识别文本中明确的否定。

搜索功能：
·支持以概念为主的搜索。除了返回结果中包含搜索条件，以概念为主的搜索返回的结果中包含同义词的搜索条件。
·支持搜索否定概念。对于如你可以搜索“否定的腺癌”，这将返回结果腺癌，有一个明确的否定。即语句，如“没有证据显示腺癌”或“没有发现腺癌”必须出现在报告中。
·支持时间查询。对于如你可以查询没有证据的促甲状腺激素细胞腺瘤患者脑血管瘤的诊断与前不到3年的
·具有独特的图形化查询的建模工具，可以轻松地制定复杂的查询。
·使用本体信息来改进搜索结果。对于。例如搜索“血管炎”将返回报告的所有子类型的血管炎，单词“血管炎”即使是不存在的报告中。
·限制搜索范围内的某些部分的报告。
支持报告标记的报告与特定的标签，然后搜索。

其他特点：
·caTIES的截图caTIES截图（点击打开大图）
·caTIES是开源的。
·可以将数据从HL7文件。
·Deidentifies遵守HIPAA法规使用第三方的标识符计划的文本。
·它具有丰富的胖客户端是通过Java Webstart的在线访问。
·使用安全的加密协议来保护所有的通信。能够使用强大的密码并记录所有的搜索活动审计的目的。
·支持组织银行和诚实的中间人。
·支持跨组织的的多个caTIES节点。完全集成的支持

要求：

·处理器Intel 3GHz以上或同等学历
·RAM 1GB +
·硬盘空间5GB + 0.04MB每份报告
·的MySQL 5.1 +或
·Oracle 9i中
·相关 Java SDK 1.5 +
·的Apache Ant 1.7 +
· Apache Tomcat 5.5的安装程序将无法正常工作了Tomcat 6
·MMTX v2.4c

此版本中的新功能：

修正的错误：
·空collection_date_time computeAgeAtAcquisition与
·加快管道
·大订单，有时不加载
·门挂针对特定的输入
·另存为“选项为现有的查询不能正常工作
·另存为“菜单中的选项不工作
·保存查询标签有问题