APBS 1.4

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APBS 1.4

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评估的静电性能的纳米级生物分子系统

APBS被设计为一个软件包，用于通过模拟生物分子的溶剂化解决方案的Poisson-Boltzmann方程或PBE。

PBE是用于说明咸，含水介质中的分子的溶质之间的静电相互作用的神器出山:www.shenqi73.com最流行的连续模型之一。

连续静电起着重要的作用，在几个方面的生物分子模拟，包括：
·模拟扩散过程，以确定配体 - 蛋白质和蛋白质 - 蛋白质结合动力学，
·隐式溶剂分子动力学生物分子，
·溶剂和结合能计算确定配体 - 蛋白质和蛋白质 - 蛋白质的平衡结合常数和援助，在合理的药物设计，
·和生物分子滴定研究。

PBS的目的是有效地评价长度尺度范围广泛的启用几十数以百万计的原子的分子的调查等模拟的静电性能。

我们还提供隐式溶剂非极性溶剂化模型的准确核算的排斥力和吸引力的溶质与溶剂的相互作用。

此版本中的新功能：

·删除了FORTRAN依赖APBS
·直接的contrib / pmgZ在线翻译的所有源行
·功能增量更换和测试，以确保代码的一致性
·创建新的子文件夹SRC / pmgC的翻译PMG库
创建新的宏2D，3D矩阵访问
·在src /的通用/ APBS / vmatrix.h的
·模拟机FORTRAN 2维和3维阵列
·使用1索引，列主顺序
·宠物直接1-1翻译从FORTRAN到ensurre的代码的一致性
·增加了额外的调试和输出宏SRC /的通用/ APBS / vhal.h
·添加的消息，错误消息，断言，预警，并中止宏
·微距修改的行为 - 启用调试标志配置
·非错误信息定向到stderr在调试，io.mc的，否则
·所有错误消息都定向到stdout
在调试模式下，提供详细的位置信息
·增加了额外的标志配置
·与fetk取代FETK_INCLUDE，FETK_LIBRARY环境标志
·与用efence使与电围栏库编译...