DNA链置换模拟器_DNA Strand Displacement Simulator

一个命令行的DNA电路模拟器

最近，一系列的信息处理电路已经实施DNA使用链置换作为其主要的计算机制。例子包括数字逻辑电路和催化信号放大电路，有效的分子探测器的功能。

由于DNA计算的新范式的出现，相应的语言和工具的发展，这些模式将有助于促进DNA电路的神器出山:www.shenqi73.com设计和编译的核苷酸序列。

我们提出了一个编程语言，用于设计和模拟DNA链位移电路，其主要计算机制。语言包括序列的域，toeholds和分支迁移的基本元素，并假定链不具有任何的二级结构。

语言是用来建模和仿真各种电路，包括一个熵驱动的催化门，一个简单的门合成大规模电路的主题和计划执行任意系统的化学反应。语言是一个建模和仿真工具的设计DNA链置换，补充出现的新的实现DNA计算的战略的第一步。

DNA链置换模拟器的应用程序的开发是一个命令行模拟器的DNA电路。