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软件的DNA指纹图谱分析

在GelQuest应用程序被设计成一个软件的选择分析的DNA指纹数据。它可以在一个快速和有效的方式跟踪文件（FSA文件）以及凝胶图像文件（TIFF，JPG，BMP等），AFLP，T-RFLP，RAPD数据处理。

注意：用户将可以注册一个免费的神器出山:www.shenqi73.com试用许可证的这里

在这里是一些主要特点“GelQuest”：

GelQuest进口跟踪数据曲线，从下列格式：
·跟踪文件格式：ABI FSA格式，贝克曼的SCF的文件，MegaBACE; RSD文件

凝胶图像：
·BMP，TIFF，JPG，GIF，SGI，欧特克，TARGA，PCX，PCD，便携地图，CUT，RLA，Photoshop中，油漆车间，PortableNetwork，EPS

数据管理和处理：
·项目文件都保存在XML格式，并包含跟踪数据，峰值数据传输，尺寸标准数据等，他们是小，因为跟踪数据都包含zip编程CDATA部分。轻松注册成立的GelQuest样品和项目纳入数据库和数据库应用程序。
·半自动车道提取的凝胶图像：轻松提取了一系列的图像格式。全部撤消功能，图像导入步骤。微笑修正。纠正扭曲的凝胶运行。
·支持多达5种颜色通道的指纹识别系统

·跟踪信号处理：平滑，基线
峰值检测与实时预览：SequentiX高峰挖掘机算法。许多峰值检测和过滤参数。

片段大小：
·允许的比较（分级）的片段，即使没有大小的标准车道
·创建/编辑用户自定义尺寸的标准模板
·带有预定义的标准模板

样品管理：
·每个样本的详细信息。
·重命名（编辑样本名）
·重新排列的样品在一个项目中，通过拖放
·从项目中删除/添加样品
·分析单个样品
·数据可视化（图形）
·选择显示的颜色通道
·曲线，色彩或灰度pseudogel图像显示
·显示/隐藏峰的位置
·原料和加工数据之间切换
·基地规模的大小或数据点
·调整所有的缩放参数。
·不同的缩放功能（放大，缩小，缩小范围）
·对于每个峰的详细信息可在飞行中
·调整缩放参数，例如正常化的RFU值整体运行或在可见光区域。
·峰值的峰值高度，宽度，面积，高度与宽度的比率，数据点，尺寸的详细信息窗口

操作简单：
是屏幕截图GelQuest的主窗口中示出的跟踪面板与峰值的细节，在窗口下部的上部区域和hyperbin表：

尺寸标准的定义：
·使用自己的标准尺寸，并产生规模标准的模板文件，可以使用任何对样品大小。自动尺寸标准匹配片段大小标准模板。准峰值施胶的地方南部的算法。通过线性回归峰发生以上，最高低于最小规模标准的峰值的大小。允许的大小和hyperbinning的片段任意长度（也适用于脉冲场凝胶电泳数据）。允许进行比较/分级的片段中，即使没有大小的标准车道。用户定义的大小标准样品模板的定义。配有多个预定义的标准模板。

Hyperbins（Superbins）：
·的自动hyperbin检测和相应的回收箱在hyperbin表上的即时可视化
·清晰地介绍基地的大小，高度，面积，面积与高度的比例或为0/1矩阵的hyperbins
·通过点击鼠标右键的轨迹上高峰期或hyperbin的表中包含或排除样品峰
·调整hyperbin检测参数和滤波器峰高度，面积，高度与宽度之比，或其他参数
·最大hyperbin宽度被自动调整为最大的基本尺寸的峰值除以2。
·过滤器由通道
·先进的当地最大的检测算法
·豳=单个样品的一个单一的峰
·Superbin容器样本的水平，与一个定义的宽度（例如1个碱基）对单个样品含箱（峰）
·Hyperbin项目serveral的样品含有的垃圾桶和superbins的容器
·出口的hyperbins为制表符分隔的表的试算表应用程序
·的出口hypberbins为01聚类分析的矩阵文件（支持格式：NEXUS，PHYLIP NEWICK PAUP和FASTA）
·开始增加分析工具ClusterVis，进行聚类分析和主坐标分析（后交通动脉）。

导出格式：
·跟踪文件（FSA格式）
·跟踪数据（原料或加工）基地缩放大小或数据点到制表符分隔的表为一个窄sheeth应用
·在制表符分隔的文件中的峰值数据
·Hyperbins作为表
·01矩阵聚类分析的文件（支持格式：NEXUS PAUP，PHYLIP NEWICK和FASTA）
·的ClusterVis（附加软件）
·聚类分析的二进制数据
·01矩阵进口，出口，编辑
·01矩阵进口，出口，编辑
·注意到在01矩阵直接从GelQuest中
·距离矩阵进口，出口，副本
·计算距离矩阵。超过50距离措施都已经实现了。 26项措施进行评估，并在当前版本中。
·群集分析，使用UPGMA及邻接算法
·可视化，集群树木的保存和复制：径向树，进化树，elliptogram，phylogram