运行环境:WinXP/Win7/Win8/Win10/Win All
软件语言:简体中文
软件类型:国产软件 - 科技软件
授权方式:共享版
软件大小:4.30 MB
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更新时间:2013-02-25 18:16:00
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的
在GelQuest应用程序被设计成一个软件的选择分析的DNA指纹数据。它可以在一个快速和有效的方式跟踪文件(FSA文件)以及凝胶图像文件(TIFF,JPG,BMP等),AFLP,T-RFLP,RAPD数据处理。
注意:用户将可以注册一个免费的神器出山:www.shenqi73.com试用许可证的这里
在这里是一些主要特点“GelQuest”:
GelQuest进口跟踪数据曲线,从下列格式:
·跟踪文件格式:ABI FSA格式,贝克曼的SCF的文件,MegaBACE; RSD文件
凝胶图像:
·BMP,TIFF,JPG,GIF,SGI,欧特克,TARGA,PCX,PCD,便携地图,CUT,RLA,Photoshop中,油漆车间,PortableNetwork,EPS
数据管理和处理:
·项目文件都保存在XML格式,并包含跟踪数据,峰值数据传输,尺寸标准数据等,他们是小,因为跟踪数据都包含zip编程CDATA部分。轻松注册成立的GelQuest样品和项目纳入数据库和数据库应用程序。
·半自动车道提取的凝胶图像:轻松提取了一系列的图像格式。全部撤消功能,图像导入步骤。微笑修正。纠正扭曲的凝胶运行。
·支持多达5种颜色通道的指纹识别系统
·跟踪信号处理:平滑,基线
峰值检测与实时预览:SequentiX高峰挖掘机算法。许多峰值检测和过滤参数。
片段大小:
·允许的比较(分级)的片段,即使没有大小的标准车道
·创建/编辑用户自定义尺寸的标准模板
·带有预定义的标准模板
样品管理:
·每个样本的详细信息。
·重命名(编辑样本名)
·重新排列的样品在一个项目中,通过拖放
·从项目中删除/添加样品
·分析单个样品
·数据可视化(图形)
·选择显示的颜色通道
·曲线,色彩或灰度pseudogel图像显示
·显示/隐藏峰的位置
·原料和加工数据之间切换
·基地规模的大小或数据点
·调整所有的缩放参数。
·不同的缩放功能(放大,缩小,缩小范围)
·对于每个峰的详细信息可在飞行中
·调整缩放参数,例如正常化的RFU值整体运行或在可见光区域。
·峰值的峰值高度,宽度,面积,高度与宽度的比率,数据点,尺寸的详细信息窗口
操作简单:
是屏幕截图GelQuest的主窗口中示出的跟踪面板与峰值的细节,在窗口下部的上部区域和hyperbin表:
尺寸标准的定义:
·使用自己的标准尺寸,并产生规模标准的模板文件,可以使用任何对样品大小。自动尺寸标准匹配片段大小标准模板。准峰值施胶的地方南部的算法。通过线性回归峰发生以上,最高低于最小规模标准的峰值的大小。允许的大小和hyperbinning的片段任意长度(也适用于脉冲场凝胶电泳数据)。允许进行比较/分级的片段中,即使没有大小的标准车道。用户定义的大小标准样品模板的定义。配有多个预定义的标准模板。
Hyperbins(Superbins):
·的自动hyperbin检测和相应的回收箱在hyperbin表上的即时可视化
·清晰地介绍基地的大小,高度,面积,面积与高度的比例或为0/1矩阵的hyperbins
·通过点击鼠标右键的轨迹上高峰期或hyperbin的表中包含或排除样品峰
·调整hyperbin检测参数和滤波器峰高度,面积,高度与宽度之比,或其他参数
·最大hyperbin宽度被自动调整为最大的基本尺寸的峰值除以2。
·过滤器由通道
·先进的当地最大的检测算法
·豳=单个样品的一个单一的峰
·Superbin容器样本的水平,与一个定义的宽度(例如1个碱基)对单个样品含箱(峰)
·Hyperbin项目serveral的样品含有的垃圾桶和superbins的容器
·出口的hyperbins为制表符分隔的表的试算表应用程序
·的出口hypberbins为01聚类分析的矩阵文件(支持格式:NEXUS,PHYLIP NEWICK PAUP和FASTA)
·开始增加分析工具ClusterVis,进行聚类分析和主坐标分析(后交通动脉)。
导出格式:
·跟踪文件(FSA格式)
·跟踪数据(原料或加工)基地缩放大小或数据点到制表符分隔的表为一个窄sheeth应用
·在制表符分隔的文件中的峰值数据
·Hyperbins作为表
·01矩阵聚类分析的文件(支持格式:NEXUS PAUP,PHYLIP NEWICK和FASTA)
·的ClusterVis(附加软件)
·聚类分析的二进制数据
·01矩阵进口,出口,编辑
·01矩阵进口,出口,编辑
·注意到在01矩阵直接从GelQuest中
·距离矩阵进口,出口,副本
·计算距离矩阵。超过50距离措施都已经实现了。 26项措施进行评估,并在当前版本中。
·群集分析,使用UPGMA及邻接算法
·可视化,集群树木的保存和复制:径向树,进化树,elliptogram,phylogram
上一个软件:箱均衡模型_Box Equilibrium Model
下一个软件:mCALC 1.0.1
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