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OSLay 1.0软件简介

序列匹配变得更加容易。

OSLay是一个方便的软件,使用匹配的序列中目标组件和引用程序集的目标组件布局的重叠群(或支架)之间的共线性。

工具提供了一个交互式的可视化计算的布局,可以进口到组装的神器出山:www.shenqi73.com编辑工具Consed关闭间隙,以支持设计的引物对的结果。

注:免费为学术目的。

下面是一些主要特点“OSLay”:

·读取两个fasta格式的文件(目标程序集和参考序列/组装重叠群)和一个BLAST / NUCmer文件的
·目标和参考序列进行排序和同时订购两个轴,如果是未完成的组件
·适用于任一原核和真核细胞的基因组
·有几种可能性进行过滤和修改数据,如无以伦比的重叠群末端修剪,过滤爆炸命中,...
·出口意见,以多种图形格式(JPG,GIF,EPS,PNG和SVG)。
·修改或生成一个新的的ACE文件直接导入到Consed简化的引物设计
·提供有用的缩放功能
·有利于组件和可视化分析的元组件,例如出现的重组或misassemblies分别。

要求:

·的Java

随便看看

软件简略信息
  • 软件大小:2.73 MB
  • 下载次数:99
  • 更新时间:2013-02-25 18:16:00
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