OSLay 1.0

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OSLay 1.0

序列匹配变得更加容易。

OSLay是一个方便的软件，使用匹配的序列中目标组件和引用程序集的目标组件布局的重叠群（或支架）之间的共线性。

该工具提供了一个交互式的可视化计算的布局，可以进口到组装的神器出山:www.shenqi73.com编辑工具Consed关闭间隙，以支持设计的引物对的结果。

注：免费为学术目的。

下面是一些主要特点“OSLay”：

·读取两个fasta格式的文件（目标程序集和参考序列/组装重叠群）和一个BLAST / NUCmer文件的
·目标和参考序列进行排序和同时订购两个轴，如果是未完成的组件
·适用于任一原核和真核细胞的基因组
·有几种可能性进行过滤和修改数据，如无以伦比的重叠群末端修剪，过滤爆炸命中，...
·出口意见，以多种图形格式（JPG，GIF，EPS，PNG和SVG）。
·修改或生成一个新的的ACE文件直接导入到Consed简化的引物设计
·提供有用的缩放功能
·有利于组件和可视化分析的元组件，例如出现的重组或misassemblies分别。

要求：

·的Java