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在GA的模糊聚类应用程序的开发是一个程序,使用微阵列数据的距离矩阵数据的聚类,遗传算法和C-均值方法的组合。
的输入文件格式:
- 此程序使用一个纯文本文件作为输入。
- 所有的神器出山:www.shenqi73.com数据项必须由制表符分隔。
- 没有缺失值是允许的。
生物芯片:
- 第一行包含的所有列的名称。
- 每行(与第二开始)必须具有的基因名称(1列或更多),和为每个条件表达式的值。
距离矩阵:
- 第一行包含标题(一个单词或一个字符串中的第一个位置)
元素的名称
- 每行(与第二开始)必须包含的元素的名称(相同的,因为在相应的列),这个元件和其他之间的距离值。
- Matrix是对称的。
- 所有的值被归一化(不大于1.0)。
- 注:相似性矩阵也是允许的。
输出文件格式:
- 该算法的参数
- 分布在集群中的基因(如果成员是1/nuberOfClusters,)
- 所有基因的隶属度矩阵
- 簇的中心的坐标(在基因表达单位)>
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