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PPH软件简介

程序推断单倍型基因型

是一个程序推断单倍型基因型,以确定是否存在导致树模型(即一个完美的亲缘关系,聚结剂)的单倍型,适合

PPH。

更多的种群遗传中,PPH决定是否可以解释为一组的SNP基因型单倍型对聚结在没有重组,无限网站模式上发展而来的神器出山:www.shenqi73.com。因此,确定为三个或四个配子测试(取决于是否树植根或不)确定单倍型数据的SNP基因型数据。

在程序中的PPH,当所输入的数据的格式的要求,选择一个数字1至7,解释如下。输入格式决定输出格式。

步骤使用本程序的步骤:
1。键入“pph.exe”启动程序。

2。请输入文件名:
输入文件名的文件,其中包含基因型或单倍型信息。

3。请输入数字的文件格式(请是指的文件“FORMAT.txt”):
这个程序可以读出七种不同的格式。请参考该文件
“FORMAT.txt”格式的更多信息。输入值应该是从1到7。

4。请输入文件名,保存祖先的载体,即在树的根的二进制向量指定字符的状态。

有两种特殊的情况下尤其重要。如果祖先的状态都为0,然后输入“d”默认情况下,如果你不知道祖先的状态,输入“M”,为广大矢量)。在这种情况下,程序将确定是否有一个无根树,可以发展的基因型。

6。将产生一个输出文件。输出文件的名称是“输出”。
的输出格式的详细信息,请参阅文件FORMAT.txt

7。该计划还检查输出的一致性。的是,它会检查每个输出的单倍型对不真正对应到正确的输入型矢量。程序报告的结果,验证步骤。

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软件简略信息
  • 软件大小:97.0 KB
  • 下载次数:99
  • 更新时间:2013-02-25 18:16:00
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