PPH

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程序推断单倍型基因型

是一个程序推断单倍型基因型，以确定是否存在导致树模型（即一个完美的亲缘关系，聚结剂）的单倍型，适合

PPH。

更多的种群遗传中，PPH决定是否可以解释为一组的SNP基因型单倍型对聚结在没有重组，无限网站模式上发展而来的神器出山:www.shenqi73.com。因此，确定为三个或四个配子测试（取决于是否树植根或不）确定单倍型数据的SNP基因型数据。

在程序中的PPH，当所输入的数据的格式的要求，选择一个数字1至7，解释如下。输入格式决定输出格式。

步骤使用本程序的步骤：
的 1。键入“pph.exe”启动程序。

的 2。请输入文件名：
输入文件名的文件，其中包含基因型或单倍型信息。

的 3。请输入数字的文件格式（请是指的文件“FORMAT.txt”）：
这个程序可以读出七种不同的格式。请参考该文件
“FORMAT.txt”格式的更多信息。输入值应该是从1到7。

的 4。请输入文件名，保存祖先的载体，即在树的根的二进制向量指定字符的状态。

有两种特殊的情况下尤其重要。如果祖先的状态都为0，然后输入“d”默认情况下，如果你不知道祖先的状态，输入“M”，为广大矢量）。在这种情况下，程序将确定是否有一个无根树，可以发展的基因型。

6。将产生一个输出文件。输出文件的名称是“输出”。
的输出格式的详细信息，请参阅文件FORMAT.txt

的 7。该计划还检查输出的一致性。的是，它会检查每个输出的单倍型对不真正对应到正确的输入型矢量。程序报告的结果，验证步骤。