IQPNNI 3.3.2下载地址

点这里下载 → 下载地址
相关Tags:

IQPNNI 3.3.2软件简介

重要四方困惑与NNI操作

名称IQPNNI代表重要四方困惑与NNI操作。一个有效的树重建的方法(IQPNNI),引入到DNA或氨基酸序列数据的基础上重建的系统发生树。我们的方法结合了各种快速算法生成一个列表潜在候选树。

主要成分是所谓的神器出山:www.shenqi73.com重要四重奏(智商),它允许计算在O(N ^ 2)的时间为n序列中间的树的定义。得到的树,然后进一步优化了应用最近的邻居交换(NNI)操作。随后,一个随机的部分序列迄今发现的最好的树被删除。

使用的重要的的四重唱令人费解(IQP)算法在较小的树,被删除的序列,然后重新插入。这些步骤重复几次,最好的树,相对于似然准则,被认为是作为推断的系统发育树。此外,我们建议的规则,这表明何时停止搜索。

下面是一些主要特点“IQPNNI”:

路模型的参数估计参数丰富的模型在极少数情况下失败
路殷钢+伽玛率异质性
路GCC 4.3.2的兼容性问题,
现在从最初的距离和校正后的最大似然的距离的两倍重建路BIONJ树

此版本中的新功能:

路模型的参数估计参数丰富的模型在极少数情况下失败
路殷钢+伽玛率异质性bug修复
路GCC 4.3.2的兼容性问题,
现在从最初的距离和校正后的最大似然的距离的两倍重建路BIONJ树

随便看看

软件简略信息
  • 软件大小:1.56 MB
  • 下载次数:99
  • 更新时间:2013-02-25 18:16:00
  • 不能下载请报告错误,谢谢
本类热门软件