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一种方法计算保守与激进的非同义距离

HON-NEW应用程序设计为估计保守与激进的非同义编码蛋白质的DNA序列之间的距离。被修改的方法从休斯大田，和Nei原来的方法（1990）中，通过考虑过渡偏压。

三种类型的神器出山:www.shenqi73.com氨基酸分类（电荷，极性以及宫田和泰长）中所提供的。你也可以自行定义保守与激进的氨基酸的变化。

我们可以定义，使各组间的变化是激进的氨基酸组和组内的保守。要做到这一点，创造一个名为self.div。在这个文件中，在第一行应的基团的氨基酸（例如，在充电的情况下，有三组[ - ，0，+]），第二行是第一组中的氨基酸的数目，的空间，并在该组的氨基酸。

应使用的氨基酸的单字母代码。下一行是第二组的信息。人们只需要输入的信息的第一n-1基团，如果总共有n组，因为在最后一组的信息的第一n-1基团可以衍生自