Copyright © 2020-2023 www.SOT9.com. All Rights Reserved .
合作联系: QQ: 3217490875
电子显微学已经成为结构生物学的重要工具。然而,许多蛋白质,可以不进行结晶,在适用于X-射线晶体学的3D液晶可以用电子显微镜研究,无论是作为单个分子或二维结晶的形式。
然而,所得到的神器出山:www.shenqi73.com结构,具有低得多的分辨率。除了极少数的例外,通过电子显微镜的电子密度图是不够的,以确定结构在原子分辨率。
在某些情况下,在另一个构象的相同的蛋白质的原子级结构是可用的。
DensityFit是与此信息相结合的低分辨率结构设计的工具。基于Python的工具,变形已知的原子结构,使得它适合低解析度的电子密度图。
描述的蛋白质是由一个弹性的网络模型,其低能量的正常模式,定义允许的变形的灵活性。此过程保证在变形过程中被保留的蛋白质的完整性。
相比其他类似的算法已发布,实施DensityFit的优势,一个中等大小的蛋白质,钙-ATP酶活性的真实的实验数据上进行了测试。对于Ca-ATP酶的算法及其应用中已经描述