DensityFit 1.0

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电子显微学已经成为结构生物学的重要工具。然而，许多蛋白质，可以不进行结晶，在适用于X-射线晶体学的3D液晶可以用电子显微镜研究，无论是作为单个分子或二维结晶的形式。

然而，所得到的神器出山:www.shenqi73.com结构，具有低得多的分辨率。除了极少数的例外，通过电子显微镜的电子密度图是不够的，以确定结构在原子分辨率。

在某些情况下，在另一个构象的相同的蛋白质的原子级结构是可用的。

DensityFit是与此信息相结合的低分辨率结构设计的工具。基于Python的工具，变形已知的原子结构，使得它适合低解析度的电子密度图。

描述的蛋白质是由一个弹性的网络模型，其低能量的正常模式，定义允许的变形的灵活性。此过程保证在变形过程中被保留的蛋白质的完整性。

相比其他类似的算法已发布，实施DensityFit的优势，一个中等大小的蛋白质，钙-ATP酶活性的真实的实验数据上进行了测试。对于Ca-ATP酶的算法及其应用中已经描述

要求：

· Python 2.2或更高
· numpy的20.0或更高的
·netcdf的3.4或更高版本
· SciPy的2.4或更高的
·MMTK各个2.4或更高