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MCALIGN2 1.02软件简介

对齐的非编码DNA序列的插入缺失进化明确的模式

可靠的非编码DNA序列是困难的,因为未知图案的插入/删除(INDEL)的事件。核苷酸差异数(显示为红色)之间截然不同的另类的路线,但没有其他的信息,它是不可能的,说这是比较合理的。

MCALIGN对准使用的神器出山:www.shenqi73.com显式模型的插入缺失演化序列,解决了这一问题,并发现的最可能的序列,或三个序列的一对对准知道亲缘关系。

插入缺失演化模型具有两个参数:(1)θ,的频率INDELS相对核苷酸替换的频率,(2):瓦特,载体的相对频率的不同长度的INDELS。一些类群的模型,或提供一种新的模式可以由用户设置。

MCALIGN2是一个精确的动态编程基础的方案,对序列对齐。如果你想调整对序列只,你应该使用这个程序。

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软件简略信息
  • 软件大小:505 KB
  • 下载次数:99
  • 更新时间:2013-02-25 18:16:00
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