MCALIGN2 1.02

对齐的非编码DNA序列的插入缺失进化明确的模式

可靠的非编码DNA序列是困难的，因为未知图案的插入/删除（INDEL）的事件。核苷酸差异数（显示为红色）之间截然不同的另类的路线，但没有其他的信息，它是不可能的，说这是比较合理的。

MCALIGN对准使用的神器出山:www.shenqi73.com显式模型的插入缺失演化序列，解决了这一问题，并发现的最可能的序列，或三个序列的一对对准知道亲缘关系。

插入缺失演化模型具有两个参数：（1）θ，的频率INDELS相对核苷酸替换的频率，（2）：瓦特，载体的相对频率的不同长度的INDELS。一些类群的模型，或提供一种新的模式可以由用户设置。

MCALIGN2是一个精确的动态编程基础的方案，对序列对齐。如果你想调整对序列只，你应该使用这个程序。