皮卡德1.85_Picard 1.85下载地址

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皮卡德1.85_Picard 1.85软件简介

Java工具,可以让你的工作与BAM文件

皮卡德建为一组用Java编程语言的工具,使您可以使用新一代测序数据的BAM格式。

现在你可以使用所有可用的BAM文件的访问,方便基于命令行的工具,您可以管理组和工作。

要求:

·神器出山:www.shenqi73.comJava

此版本中的新功能:

·错误的修复 - LittleEndianInputStream将挂在无限循环,如果EOF遇到过的空终止。
·包括特里布尔构建/测试主build.xml,一些重构。使用SAM版本号特里布尔
·移动org.broadinstitute.variant的Picard回购
·修改后的build.xml的变体类构建和打包成一个单独的jar
·做了必要的修改,运行单元测试
·合同的Java启用。现在,这些运行正常的“蚂蚁测试”的一部分。请注意,我们的测试是为“健谈”作为你的,所以会有一个短暂的停顿输出而变异测试运行。
·将所需的cofoja(合同的Java)和Apache Commons的依赖到lib /
·移动JEXLMap从顶层的文件VariantJEXLContext成员的自己的类
·CollectGcBiasMetrics.java:创建命令行参数(简称BS)处理亚硫酸氢钠测序读。 CollectGcBiasMetrics将使用亚硫酸氢盐的了解countMismatches()如果为true。
·添加合并和SplitVcfs,两个实用程序的详细信息...

随便看看

软件简略信息
  • 软件大小:35.4 MB
  • 下载次数:99
  • 更新时间:2013-02-25 18:16:00
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