运行环境:WinXP/Win7/Win8/Win10/Win All
软件语言:简体中文
软件类型:国产软件 - 其它软件
授权方式:共享版
软件大小:1.27 MB
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更新时间:2013-03-08 10:44:00
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DNA BASER是一个有用的程序,它被设计作为一种工具,用于快速组装的DNA序列。我们脑子里的一些功能,大大降低了所需的用户输入一个快速组装发动机和实施。这些功能已成功实施,使当前版本的神器出山:www.shenqi73.comDNA BASER可组装4种微量元素约800个碱基每2秒内的平均系统配置文件。
结束的原始跟踪文件的,矫正质量值的基础上的暧昧基地的建议微调,从最后的重叠群的克隆载体序列自动删除仅是一些例子,功能齐全的特点,使组装的DNA序列更容易和更短的时间,耗时。
DNA BASER是理想的组件的几乎任何类型的序列,例如在ssu的rRNA基因(16和18S rRNA),LSU rRNA基因(23和28S),蛋白质的基因或基因组片段。如需详细资讯,请切换到“功能页面(链接功能)。
这使得DNA测序劣等生物多样性,分子生态学研究的理想工具,各种功能和结构的基因,基因组或宏基因组测序,克隆和测序的DNA为基础的几乎任何应用程序。
DNA BASER可以使用ABI和SCF文件类型的,也是简单的文本文件格式,如TXT,FASTA序列。
我们提供的DNA BASER,包在一个非常容易接近的价格,这使得软件能够方便地适用于大学,研究机构或私人公司,利用DNA测序。
对齐的核心功能
*序列是根据ABI或SCF格式的跟踪文件自动组装。的组装算法是非常快的:4 SCF文件,800个碱基的装配需要不到3秒钟的平均电脑(AMD 1.2 GHz的)
*基于它们的质量价值观的跟踪文件的端部被自动剪裁(QV);修剪引擎的分辨率可以完全由用户调整,此操作可以节省用户的显着的时间,作为手动'清洗'的跟踪序列无需
*原始跟踪文件和产生重叠群同步和显示等,使校正更容易暧昧的基地
*使用QV中,DNA BASER改正的暧昧基地的建议;率测试过程中记录的正确意见,比90This意味着用户必须确认该软件的建议,而这又降低了整体的处理时间
*反补:反向序列在组装过程中自动打开
*自动切向量序列,如果您指示DNA BASER到这样做。 DNA BASER来自与常用的载体/引物序列,被更新的数据库,该数据库可以由用户根据自己的中断向量/引物序列的数据库。利用这些序列,DNA BASER将删除向量序列从最后的重叠群
*查看跟踪文件(格式ABI和SCF)
特殊功能
*良好的价格和重大折扣订购多个许可证。有关详细信息,请参阅价格
*特种牌照(扩展许可证)。了解更多关于扩展许可证。
*特殊设计的接口,用于快速处理色谱文件
*批量模式汇编:您可以指示BASER的组装分发文件夹中的所有跟踪文件,而你是在休息时间
*多种文件格式之间的转换
*其他特殊功能包括用户界面友好,色彩丰富,直观的界面,外观模式和音频的预警系统。用户可以完全控制在图形用户界面(GUI)和声音。
限制:
·QV可能无法显示/正常工作非常古老的的SCF的文件(SCF 2.00)
限制:
·30天试用版
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