IdeogramBrowser 0.20.4

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IdeogramBrowser 0.20.4

染色体分析变得更加容易。

IdeogramBrowser是一个方便的，基于Java的应用程序设计用于方便地比较一组输出文件的Affymetrix公司的染色体拷贝数分析工具。在核型表示的基因杂合性缺失（LOH）或损失/收益标记，绘制和其相应的神器出山:www.shenqi73.com染色体区域。

下面是一些主要特点“IdeogramBrowser”：

·绘图的SNP标记核型图（从NCBI MapView类的汉字表产生总是有新的36.2数据库）。请参阅附录A中更改默认的数据库。
·SNP数组的大小为10K，50K，100K，和500K可以导入从Affymetrix公司的拷贝数分析工具（CNAT 3和4 CNAT）直接在CNT文件格式（版本1.0和1.1）。
·一般的制表符分隔的文本文件格式，可以导入引进国外的数据（例如，所产生的电子表格应用程序，例如Microsoft Excel）。所以软件并不限于Affymetrix公司的SNP阵列和Affymetrix的拷贝数分析工具（CNAT 3和4）。 SNP分析可以结合例如阵列CGH数据。新CNAT 4格式将蕙在第二个文件中的标记。如果文件具有相同的前缀LOH的文件会自动加载，在打开的拷贝数（CN）文件。
·绘制基因的分子标记，从NCBI MapView类数据库的本地副本（BUILD 36.2）
·批处理/多文件导入。合并分割的文件。
·阈值，LOH log2ratios（杂合性缺失），SPA（单点分析拷贝数），GSA（平滑基因组拷贝数）标记生成的值（后者仅适用于超过1万个SNP位点）的芯片。
·通过过滤功能的降噪
·Conensus地区的代表性。
·到http://www.genecards.org的链接
·导出JPG，SVG和PDF格式。
·打印功能（打印可能无法正常工作在Linux下CUPS结合 - 这是一个Java 1.5/CUPS的问题：将图表导出为PDF和打印，如使用Acrobat Reader）
·简明模式包括只显示轮廓线与畸变。

要求：

·的Java

此版本中的新功能：

·文件导入 - 错误修复。
·内存泄漏 - 错误修复。