DNA龙1.1.9.1_DNA Dragon 1.1.9.1

DNA序列重叠群汇编软件

DNA龙是一种先进的DNA的工具，可以处理超过10万个样本的序列格式（FASTA，EMBL，GenBank登录号等）的跟踪文件格式（SCF，ABI，AB1）和下一代测序的文件格式（Illumina公司， SFF，GFF等）。

的神器出山:www.shenqi73.com“DNA龙”注意：使用“许可证”按钮，在软件的试用版可以激活。

下面是一些主要特点：

·序列读取最流行的格式：（FASTA，GenBank登录，EMBL，SCF，ABI，AB1，社保基金理事会，下一代）。
·多重修剪功能：矢量，质量和长度的修剪。
·快速装配机处理项目超过10万个序列。

支持的文件格式：

项目文件：
·XML DNA龙的XML项目（*。XML）

序列文件格式：
·EMBL（*，EB *。EBI *。EMBL）
·序列（*。GB *。根;。序列*。TXT）
·FASTA（*。发; *。的FAS *。快。FASTA * FS;。金融服务局（fsa）。FSTA）

新一代测序的文件格式：
·ABI公司的SOLiD文件（*。GFF）
·固体CSFASTA文件（*。csfasta）
·公司Solexa紧凑型ASCII阅读的格式，围巾（S_ * _sequence.txt）
·Illumina公司_seq.txt文件（*。TXT）
·Illumina公司FASTQ文件（*。fastq）
“Illumina公司Qseq文件（* _qseq.txt）
·454标准flowgram文件，（*。SFF）

对齐的文件格式：
·序列比对/地图（SAM）格式（*。SAM）
·二进制对齐格式（*。BAM）（*。BAM）[中]

追踪文件格式：
·SCF（*。标准立方英尺）
·ABI（ABI; AB1）

导航树：
·A样品的导航树项目结构（重叠群和样本）很清楚。从此处的样本被选择，然后修剪和组装。

修剪和untrimming功能：
·入门限幅
·矢量的裁剪与自动pseudocircularization（50个碱基）。您可以检测假定向量图案序列中没有任何以前的知识。
·序列质量微调
·长度的修剪
·Untimming：恢复裁剪结束。

组装机和重叠群编辑：
·改变组装参数的各种选项可供选择。快速的，基于索引的装配序列自动排序的序列内的重叠群（偏移和装饰的目的），使项目管理的乐趣。
·校对的重叠群序列比对，即与他们的踪迹基地的比较，以及导出/复制的共识序列几乎是不言自明的。