DAMBE 5.2.30

生物信息学的工作台用于执行各种分析各种分子数据文件

DAMBE是一种小型，易于使用的应用程序，专门帮助您与数据分析和分子生物学与进化。

这些都是一些DAMBE功能：

序列比对：
·通用序列比对，核苷酸和氨基酸序列
·对齐蛋白质的神器出山:www.shenqi73.com核苷酸序列编码对对准的氨基酸序列的

分子系统发育：
·基于距离的方法，包括邻接，惠誉Margoliash，FastME和UPGMA，连同各种遗传距离，包括同时估计的最大复合可能性的距离，以及各种距离的基础上的核苷酸，氨基酸和密码子置换模型，例如，一般时间可逆模型（GTR）的核苷酸序列或微卫星数据的基础上逐步突变模型的基础上的距离。
·最大简约法
·最大似然方法
·多功能的树显示面板出口高品质的树木出版的
·核苷酸为基础，基于密码子模型的相对速率测试
·树的分子钟假说为基础的测试
·约会物种或基因复制事件与单个或多个校准点
·检测重组（辛普劳，BOOTSCAN和兼容性矩阵的基础上的一种新方法）

估计：
·率异质性的伽玛分布的形状参数
的比例不变网站
·测试替代饱和
·寻找最匹配的替代模型

生物信息学工具：
·您的位置权重矩阵表征和预测基序
·感知器的双组分类的基序
·吉布斯采样表征和预测的小说/隐藏序列图案
·隐马尔可夫模型
·二级结构预测
·tRNA的反密码子识别
·RSCU和CAI的密码子使用偏好与表征
·计算蛋白质的等电点
·肽质量指纹图谱

·广泛实施的各种序列格式，从最简单的FASTA格式的注释丰富的GenBank格式。与GenBank格式，可以很容易地提取编码序列（CDS）的，外显子，内含子，外显子 - 内含子交界处，rRNA基因，tRNA基因，序列的上游或下游的信用违约掉期，和其他许多人。