pknotsRG 1.3

RNA折叠和热力学匹配工具。

pknotsRG是一个折叠的RNA二级结构，包括简单的递归假结之类的工具。

该程序运行在O（N ^ 4）时间和O（N ^ 2）的空间，因此，其应用的BiBiserv这里是有限的长度可达800个碱基的神器出山:www.shenqi73.com序列。不含有假结结构的能量参数是相同的，在实际mfold的3.1。的折叠式的温度被固定到37C。

目前，有三种不同的模式可供选择：
pknotsRG-MFE：计算最小自由能（打结或没有）的结构的。
pknotsRG-ENF：实施了假结：它提供了大力最好的完整的结构，包括至少一个假结的地方。
pknotsRG-loc：表示提供当地最好的，可以是任何结构元件的s，其中每个核苷酸的自由能“最好的”是指由假结。其余的遗体展开

获取pknotsRG和旋转，看看它实际上可以为你做！