Circonspect 0.2.5

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工具，用于创建重叠群谱

Circonspect，也被称为，控制研究CONTIG光谱）建立以产生重叠群谱是基于随机子集的宏基因组的组装。

然后可以建模的重叠群光谱下游获得多样性估计（例如与PHACCS）。

可以创建不同种类的神器出山:www.shenqi73.com重叠群谱：α-多样性，混合重叠群谱，γ-多样性和交叉重叠群谱，β多样性的标准重叠群的频谱。

构建一个交叉重叠群的频谱要求建立一个混合的的重叠群光谱，这需要几个选定的宏基因组（FASTA文件）的基础上建立正常重叠群谱。

Circonspect使用一个的索引序列数据库来存储临时数据。任何汇编程序支持最小重叠长度和相似适于，在这个时候，Minimo浏览器，TIGR的汇编程序，汇编程序LIGR，CAP3和Newbler支持。

当多次重复进行（引导程序），平均重叠群频谱是
计算出来的。用户可以控制通过修整它们到一个给定的长度，除去小于一个阈值的序列的序列的大小。

要求：

·Perl的
·Minimo浏览器汇编

此版本中的新功能：

·迁移到git
·修正错误，允许-r和-k来指定所有，虽然他们是独家