FONZIE 12.2010

用这个工具查找标记

FONZIE信息学是一个基于Python的应用程序所建立的遗传制图专业。

FONZIE可以让你找到一组序列和联营公司的寡核苷酸作为标记。

FONZIE调用串联重复搜索上输入核酸序列文件（FASTA格式）。
每个标记筛选关于不同标准（大小，％匹配的神器出山:www.shenqi73.com输入序列中的特定区域中的存在）。

然后，标记物的灵敏度建立对数据库进行BLAST的核酸序列（其中包括输入文件）。此数据库之前创建的使用FONZIE。

在下一步骤中，引物对的设计，使用引物，为所选择的标记。 FONZIE然后测试对数据库的扩增产物，使用BLAST的灵敏度。

输出文件FONZIE是一个制表符分隔的文本文件，包括标记和引物上的数据，这是一个dat文件的输出TRF和3个目录分别包含标记序列的FASTA，扩增产物在FASTA序列和数据文件每个标记。