磨床0.4.8_Grinder 0.4.8

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磨床0.4.8_Grinder 0.4.8

工具为产生随机扩增子和猎枪库的

Grinder是一个程序，它允许你创建的人工随机猎枪和扩增子序列库。

一个FASTA文件中的参考序列的基础上生成的库。磨床能产生宏基因组，pyrotag数据集或鸟枪法测序项目，可以用来测试的神器出山:www.shenqi73.com准确性，生物信息学工具之间的替代测序方法，在实验中，帮助决定。

这里是“研磨机”的一些主要特点：

·任意数量的读取和读长度分布
·模拟各种PCR和测序错误：嵌合体，点突变，均聚物
·随机猎枪图书馆或扩增子库（例如16S）
·支持创建配对末端猎枪数据集
具体的排名丰度或手动指定每个基因的丰度
·创建的独立数据集，不共享任何基因组
·创建由不同基因组的长度的偏置建模
·禁止字符
·α和β多样性的要求

要求：

·Perl的

此版本中的新功能：

·修正错误时，扩增产物读取使用指定多个扩增子的基因组的基础上的相对丰度。
·使用消息的改善。
·委托一些操作，以专用模块。