PHYLIP 3.69

一揽子计划，推断系统发育

系统发育推断包（PHYLIP）是一个软件包，推断进化树（谱系）。

包中提供的方法包括简约，距离矩阵，似然方法，包括引导和一致树。

可以处理的数据类型包括分子序列，基因频率，限制性酶切位点和片段，距离矩阵，和离散的字符。

该方案是通过菜单控制，要求用户要设置哪些选项，并允许他们开始计算。从一个文本文件，用户可以准备使用任何文字处理器或文本编辑器（但重要的神器出山:www.shenqi73.com是，这个文本文件的特殊格式，文字处理器的数据读入程序 - 它应该是在“平ASCII”或“仅文本”格式）。

clustalw的联合计划的一些序列分析程序，如可以写在PHYLIP格式的数据文件。大部分节目寻找一个名为“INFILE”中的数据 - 如果他们没有找到这个文件，然后要求用户输入的数据文件的文件名。

输出写入到文件的名称，如“输出文件”和“outtree”。树书面到“outtree”的Newick格式，非正式同意的标准于1986年由作者的一些主要的系统发育包。

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